A Síndrome Metabólica Equina pode ser diagnosticado através da história clínica, detecção de obesidade ou depósitos de adipócitos regionais e de resistência à insulina. Cavalos suspeitos devem ser testados para resistência à insulina, submetendo uma amostra de plasma para medição de glicose e insulina. A análise bioquímica pode revelar hipertrigliceridémia, hiperleptinémia e hiper ou normoglicemia